Phòng thí nghiệm PCR cần được chia làm 3 hoặc 4 khu vực:
· Khu vực 1: chuẩn bị mẫu (làm mẫu và tách chiết)
· Khu vực 2: trộn hóa chất (PCR mix)
· Khu vực 3: chạy máy PCR
· Khu vực 4: chạy điện di và đọc kết quả
>>> Xem ngay máy điện di và các thiết bị cần thiết cho khu vực điện di
Các khu vực cần được tách biệt và được bố trí kín với lối vào riêng, đồng thời sử dụng hệ thống lọc không khí riêng biệt như điều hòa…
Khu vực chạy máy PCR phụ thuộc vào phương pháp PCR sử dụng. Nếu sử dụng phương pháp PCR liên quan đến việc mở nắp ống
PCR ( thường gọi phương pháp PCR cổ điển, sau khi PCR cần có quá trình điện di, hoặc lai phân tử) thì khu vực đặt máy PCR cần đặt
đủ xa khu vực 1 và khu vực 2. Đảm bảo rằng hệ thống thông khí các phòng này không liên kết với nhau và với các khu vực khác.
Khi xây dựng phòng PCR, cũng lên chú ý có một phòng riêng để thay quần áo, ăn uống và có một phòng riêng để các vật tư tiêu hao cho
PCR: như đầu côn, rack, khẩu trang, găng tay…
Tất cả các phòng lên có đèn UV để khử trùng. Tủ an toàn sinh học cấp 2 cần đặt trong khu vực 1 để xử lý mẫu. Điều này sẽ đảm bảo an toàn
cho người sử dụng khi thao tác với các mẫu bệnh có thể gây bệnh cho người. Trước và sau khi xử lý mẫu lên bật đèn UV khử trùng. Các
công đoạn như nghiền mẫu, ly tâm, tách chiết DNA/RNA được xử lý ở khu vực này.
Khu vưc để trộn hóa chất chạy PCR cần được chuẩn bị trong tủ thao tác PCR (PCR cabinet) . Tủ thao tác PCR cần có đèn chiếu sáng và
đèn huỳnh quang để đảm bảo khử trùng. Tất cả các dụng cụ PCR cần được đánh dấu và chỉ được sử dụng trong khu vực 2. Các dụng
cụ tiêu hao sạch mới được phép chuyển vào trong khu vực này.
Sau khi quá trình PCR kết thúc , ống PCR cần được chuyển sang khu vực điện di hoặc lai phân tử mà không được mở nắp ống.